2.3 Auto-Docking分子对接 用AutoDock Vina软件模拟戈米辛D对α-葡萄糖苷酶的分子对接情况。根据文献报道本文选择α-葡萄糖苷酶晶体结构的PDB ID为2QLY[10]，三维晶体结构见图1。用ChemBio Draw画出戈米辛D和阿卡波糖的结构式，导入ChemBio 3D将两者的三维结构能量分别降至最低。采用遗传算法(genetic algorithm，GA)计算与蛋白质结合的药物分子的可能构象。在对接过程中，最多考虑了化合物的10个构象，取结合自由能最低的構象用来做进一步的分析。

    2.4 紫外光谱法 配制戈米辛D不同浓度分别为0.25，0.5，1.25，2.5，5.0 μmol·L-1。 α-葡萄糖苷酶浓度稀释至0.5 mg·L-1。100 μL不同浓度戈米辛D溶液加900 μL酶溶液混合装于1.5 mL EP管中，以乙酸铵缓冲液作为对照，用紫外分光光度仪扫描并观察戈米辛D与α-葡萄糖苷酶相互作用前后的紫外光谱图[11]。

    3 结果与讨论

    3.1 α-葡萄糖苷酶反应体系的优化 为了小分子与酶蛋白在适宜条件下反应，实验前期先对α-葡萄糖苷酶的反应条件进行了优化，包括反应时间、缓冲液pH以及水浴温度等。结果显示 ......