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编号:13012332
基于转录组测序的山茱萸次生代谢生物合成相关基因的挖掘(3)
http://www.100md.com 2017年1月15日 《中国中药杂志》 2017年第2期
     24COG 相关功能分类COG(clusters of orthologous groups)数据库是对基因产物进行同源分类的数据库,是一个较早的识别直系同源基因的数据库,通过对多种生物的蛋白质序列大量比较而来的。将山茱萸unigene与COG 数据库进行比对,预测unigene功能并进行分类统计。研究结果表明,山茱萸unigene根据其功能大致可分为25类。unigene涉及的COG功能类别比较全面,其中,一般功能预测类基因最多(2 300个);其次是复制、重组和修饰类基因(1 425个)、转录类基因(1 141个)、信号转导类基因(1 013个)和翻译、核糖体结构和生物合成类基因(893个);而核结构类基因(5个)和细胞运动类基因(8个)较少;未发现胞外结构类基因,见图2。

    25KEGG分析KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)数据库是系统分析基因产物在细胞中的代谢途径以及这些基因产物功能的数据库。将KEGG pathway数据库作为参考,可将11 554个unigene定位到126个具体的代谢途径分支 ......
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