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编号:12858659
三七几丁质酶基因PnCHI1的克隆及表达特性分析(4)
http://www.100md.com 2016年6月1日 《中国中药杂志》2016年第11期
     根据氨基酸序列的相似性和几丁质结合结构域的有无可把几丁质酶分为7大类:class Ⅰ~class Ⅶ[6-7]。为了研究PnCHI1的系统进化地位,选取了7个类型的几丁质酶构建系统进化树(图3)。聚类结果显示,16个几丁质酶聚为2大支,Ⅰ,Ⅱ,Ⅳ,Ⅵ,Ⅶ类几丁质酶组成上部的一大支,进化树的下端一支由Class Ⅲ和Class V类型的几丁质酶组成,他们属于糖苷水解酶18家族。PnCHI1与5个Ⅳ类几丁质酶聚为一小支,表明PnCHI1编码的蛋白质属于Ⅳ类几丁质酶。

    3.3 PnCHI1编码蛋白质的理化性质及信号肽预测 利用ProtParam在线工具预测三七几丁质酶的理化性质,结果显示三七几丁质酶的相对分子质量约为29.36 kDa,等电点约为4.77。Lam和Ng从三七根中分离的几丁质酶相对分子质量为15 kDa[22],两者相对分子质量相差近1倍。SignalP 4.1分析结果表明PnCHI1中存在信号肽(第1~21位氨基酸残基)。此外,PredictProtein预测分析显示PnCHI编码蛋白质为分泌蛋白 ......
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