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编号:12618511
红腺忍冬绿原酸生物合成新基因克隆及其生物信息学分析(3)
http://www.100md.com 2015年3月1日 中国中药杂志 2015年第5期
     2.3 LHPAL4蛋白特性及表达模式分析 由于LHPAL4是从红腺忍冬中获取的一个同源基因,利用BLASTX和ORF Finder预测其含有一个完整的开放阅读框。序列比对分析结果表明,LHPAL4与LHPAL1,LHPAL2,LHPAL3的核苷酸序列同源性分别为48.39%,27.78%,47.46%;氨基酸序列同源性分别为8.57%,7.18%,7.38%。利用 CFSSP 软件对 LHPAL4 蛋白的二级结构进行预测, LHPAL4蛋白残基组成为α-螺旋(H) 为71.3%、β-折叠 (E) 为41.6%、β-转角 (T) 为12.2%,见图2。

    为了进一步分析LHPAL4的基因表达模式,本文比较了LHPAL4基因在红腺忍冬叶、花蕾及败花中的转录水平。结果表明,LHPAL4在3种器官中的表达量为败花>叶>花蕾,其与LHPAL1的表达模式略有差异[5]。邓玲姣、周晓舟等[11-12]认为绿原酸在红腺忍冬花蕾中的含量比叶中的低 ......
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