比较结香和未结香样品多样性，发现5个结香样品的细菌T-RFs、香农多样性指数均高于同组未结香样品。对比结香与相应未结香样品的T-RFs片段，统计两者差异的T-RFs片段数目见表1，同组样品间差异的T-RFs片段数占总T-RFs片段数60%以上，说明结香前后白木香内生细菌的种类发生显著变化。

    3.2相似性聚类分析聚类分析能够反映样品间微生物群落的相似性，各样品Hinf Ⅰ酶切带谱聚类分析结果见图1。沉香形成是长期、复杂的过程，内生细菌可能受到如结香时间、结香技术、地域环境、宿主植物生理状态差异等诸多因素影响，造成聚类结果比较复杂。但是从聚类结果可以看到，J3，J4相似性最高聚成一类，W3，W4，W1比较相似聚成一类，J2，J5，J1聚成一类，W5，W2聚成一类，5组样品中并不是结香和对应非结香样品内生细菌群态相似性最高聚在一起，而是结香样品间的细菌群态相似性最高，非结香样品间的细菌群态相似性最高，说明沉香形成中内生细菌发生明显的，规律性的变化。

    3.3优势种群分析每个样品视前3 个最大的峰面积对应的T-RFs为该酶切得到的优势种群，因Hinf Ⅰ酶切获得片段数目较多，所以根据Hinf Ⅰ酶切图谱比较结香和未结香样品优势种群片段及丰度差异 ......