滇重楼内生真菌分离与多样性研究(2)
1.4 数据分析采用BioXM2.2，ClustalX1.83对序列进行处理和分析，并用MEGA5构建系统发育树，选择参比序列，以Kimura-2参数模型计算进化距离，用邻接法通过1 000步重估获得的自展检验数值标记在分支上，使用Treeview 1.66输出树形图。
采用分离率(isolate rate)分析滇重楼内生真菌在不同样地和不同部位的分布情况，即分离率=分离到的内生真菌菌株总数/供试植物组织块数总数。采用Berger-parker优势度指数(D/Di=Ni/N)分析1个种(属)在群落中的地位与作用，其中N为群落内各属(或种)级真菌菌株的数量之和，Ni为群落中属(或种)级真菌i的数量。采用Shannon-Wiener多样性指数(H′)分析滇重楼内生真菌的丰富程度和在不同样地、部位间分布的均匀度，多样性指数H′=-ΣPiln(Pi) ，其中Pi=Ni/N ......
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