2.3 铁皮石斛HSP70的生物信息学及进化分析

    运用ProtParam分析，表明该蛋白分子质量为71.1 kD，理论等电点(PI)为5.13，理论半衰期为30 h，不稳定指数为31.73，属于稳定蛋白。在氨基酸的构成中，相对含量较多的是Ala，Lys，Gly，分别占8.3%，8.2%，8.0%。总的带负电荷残基(Asp+Glu)为99个总的带正电荷的残基(Arg+Lys)为83个。ProtScale工具预测该蛋白为亲水性蛋白，TMHMM工具对该蛋白的跨膜结构进行预测发现其无跨膜区，全部存在膜外。

    运用HNN软件预测铁皮石斛HSP70的二级结构，结果显示该蛋白的二级结构由44.2%的无规则卷曲(random coil)、38.79%的α-螺旋(α-helices)和17%的延伸链(extended strand)组成(图4)，推测无规则卷曲是铁皮石斛HSP70最大量的二级结构原件而α-螺旋和延伸链散布于整个蛋白中。

    为进一步分析铁皮石斛HSP70与其他植物HSP70之间的进化关系 ......