多产区川芎内生真菌菌群组成的PCR—DGGE分析(2)
3 结果3.1 DNA提取
各产区川芎组织样品中提取到的DNA溶液经1%(质量分数)的琼脂糖凝胶电泳检测，结果显示各样品的DNA均已提出，通过与DNA marker对比，其长度约为1.5 Mb，且亮度和纯度都较好，没有出现拖尾现象，说明DNA的提取结果良好。
3.2 PCR扩增
为了排除了植物或其他真核生物DNA的干扰，采用针对真菌ITS区设计的2对引物进行Nested-PCR[12]。各样品PCR扩增条带亮度和纯度较好，未出现非特异性扩增。通过与DNA marker对比，可知其最终产物DNA片段大小约250 bp，见图1。与目的片段长度相符，符合DGGE的分离条件。说明PCR扩增效果良好，可进行DGGE分析。
3.3 内生真菌群落多样性分析
3.3.1 DGGE图谱分析 在适当的电泳条件下，DGGE能将只有单个碱基差异的不同DNA片段分离[13]，即每1个条带可以代表1个物种。从DGGE条带可见，5个产区的19个代表性川芎样品中检测出的清晰可辨条带共23条，其中各样品间共有条带2个(f ......
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