2.6 分子对接

    运用Sybyl-X 1.1软件“Surflex-dock”模块对受体靶标蛋白的三维晶体结构进行移除配体、去水分子、加氢等处理[19]，再通过蛋白晶体中原有的配体获取对接口袋，将活性最高的10号分子与受体靶标蛋白进行对接，得到配体与受体的结合构象，并设置生成20个输出对象，根据打分函数(“C-score”和“Total score”)找出活性最高的分子，从理论上分析配体与受体的结合位点及相互作用方式。

    2.7 新结构分子设计及活性预测

    结合新建的3D-QSAR模型，参考各三维等势图的色块和分子对接结果，以活性最高的10号分子为结构模板，利用PyMOL V1.5软件(美国Schr?dinger公司)进行分子设计与结构改造，利用Sybyl-X 1.1软件、采用CoMFA法和CoMSIA法进行活性预测。

    3 结果

    3.1 分子叠合结果

    模型分子叠合图见图3。

    3.2 3D-QSAR模型的相关数据及预测能力

    用CoMFA和CoMSIA模型分別对训练集、测试集分子进行内部和外部预测 ......