【摘要】 目的 分析微生物宏基因組二代测序(mNGS)在急性或亚急性脑炎或脑膜炎患者脑脊液中检出的DNA病毒特征和临床意义。方法 对疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎并接受脑脊液mNGS的病例进行回顾性分析，按照临床诊断分组并比较各组检出的DNA病毒种类、特异序列水平[每1 M序列中的比对序列数(RPM)]和传统病毒病原学检查结果。结果 160例疑诊急性或亚急性脑炎或脑膜炎的病例分别有30例(18.8%)、85例(53.1%)和45例(28.1%)的临床诊断为病毒性脑炎或脑膜炎(不能区分DNA病毒和RNA病毒)、其他感染性脑炎或脑膜炎(细菌、真菌或寄生虫)和非感染性脑炎或脑膜炎(免疫炎性、肿瘤等)，这3组中分别有8例(26.7%)、30例(35.3%)和8例(17.8%)检出DNA病毒。病毒性脑炎或脑膜炎组mNGS检出的病毒均为疱疹病毒，以单纯疱疹病毒1型、水痘-带状疱疹病毒和巨细胞病毒最常见，其RPM有很高的，但大部分均很低，去除RPM≥100的数据后，其平均RPM与非感染性脑膜炎组和其他感染性脑膜炎或脑膜炎组比较差异无统计学意义(P > 0.05) ......