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编号:13565541
人角质形成细胞应对红色毛癣菌感染的差异表达基因(1)
http://www.100md.com 2019年2月1日 《新医学》 20192
人角质形成细胞应对红色毛癣菌感染的差异表达基因,人工表皮,核糖核酸-seq
     【摘要】 目的 筛选角质形成细胞应对红色毛癣菌感染的差异表达基因与关键基因。方法 构建红色毛癣菌感染人工表皮模型与阴性对照组一起进行RNA-seq测序分析。结果 在红色毛癣菌孢子感染人工表皮后共筛选出了1 564个差异表达基因,包括1 102个上调基因与462个下调基因。这些差异基因的Go分析结果主要富集于生物学调控、膜及膜组分和催化功能。通过kegg通路分析,差异表达基因主要富集于与结直肠癌、赖氨酸降解和肌醇磷酸代谢相关通路。另外,蛋白互作分析发现PHLPP2和TOP2B这2个基因节点的度最高,可能在人角质形成细胞应对红色毛癣菌感染中具有重要的作用。结论 筛选出了1 564个角质形成细胞应对红色毛癣菌感染的差异表达基因,这些基因可能在人角质形成细胞应对红色毛癣菌感染中具有重要作用。

    【关键词】 人工表皮;红色毛癣菌;核糖核酸-seq

    【Abstract】 Objective To screen the differentially-expressed and key genes in the keratinocytes in response to Trichophyton rubrum infection. Methods The artificial epidermis model infected by Trichophyton rubrum was established. RNA-seq was performed in the reconstructed human epidermis and negative controls. Results A total of 1 564 differentially-expressed genes were identified ......
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