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编号:13565053
人角质形成细胞应对红色毛癣菌感染的差异表达基因(2)
http://www.100md.com 2019年2月1日 《新医学》 20192
     四、方 法

    1.感染模型构建

    感染模型的构建参考既往研究成果[9]。红色毛癣菌T1a接种于马铃薯葡萄糖琼脂斜面培养基上,27℃培养14 d,连续活化2次以上,每管加入3 ~ 4 ml的0.85%无菌生理盐水,用接种环轻轻刮取菌落表面,收集孢子和菌丝的混合悬液。用11 μm孔径的无菌Whatman滤纸过滤得到孢子悬液。用0.85%无菌生理盐水清洗2次,4 000 rpm,离心10 min,弃去上清液,加适量0.85%无菌生理盐水重悬沉淀的孢子。用细胞计数板进行孢子计数,制成终浓度分别为8×104 cfu/ml的孢子悬液备用。在人工表皮的中央垂直加入5 μl混匀的孢子悬液(400个孢子)构建感染模型,加等量的无菌生理盐水作阴性对照。37℃,5% CO2培养,每2 d更换维持培养基。

    2.人工表皮角质形成细胞转录组测序

    RNA提取:感染后96 h,分离人工表皮,采用Trizol法提取总RNA,随后使用Illumina HiSeq平台进行RNA-seq测序。本研究中采用RPKM(Reads Per Kilobase Millon mapped reads)来表示基因表达量水平 ......
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